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百度开放LinearFold算法 可提升新冠病毒RNA结构检测速度

 2020-02-01 09:21  来源: A5创业网   我来投稿   西瓜的个人主页 撤稿纠错

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A5创业网(公众号:iadmin5)2月1日报道,百度研究院宣布,将向各基因检测机构、防疫中心及全世界科学研究中心免费开放线性时间算法 LinearFold 以及世界上现有最快的RNA结构预测网站,以提升新型冠状病毒RNA空间结构预测速度,从而助力疫情防控。

据悉,该算法使得整序列、整基因组的 RNA 结构预测成为可能,也是RNA结构预测领域40年来第一次重大提速。这项工作发表于生物信息学顶级会议 ISMB 2019 和生物信息学权威杂志 Bioinformatics,受到了诸多业内专家的高度评价。

值得一提的是,由于新型冠状病毒已经在多个国家出现,百度开放LinearFold网站给全世界科学家免费使用,较同类网站相比,在RNA结构预测速度和序列长度方面,该网站都具有明显优势,在预测速度上无出其右,而且能处理的最长序列长度达10万碱基,能满足对RNA病毒全基因组结构预测的要求。

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作者: 西瓜    /    文章:551篇

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